Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms