Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVV-2B6SEH9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms