Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms