Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms