Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC6A4-203ENST00000401766 6543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms