Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TLR1Q15399 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms