Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KIF5AQ12840 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KIF5AQ12840 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KIF5AQ12840 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIF5AQ12840 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIF5AQ12840 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIF5AQ12840 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KIF5AQ12840 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KIF5AQ12840 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms