Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALD1Q05682 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms