Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms