Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms