Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms