Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIRAP54198 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIRAP54198 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIRAP54198 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms