Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCAP28676 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCAP28676 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCAP28676 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCAP28676 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCAP28676 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCAP28676 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCAP28676 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCAP28676 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCAP28676 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCAP28676 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCAP28676 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCAP28676 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCAP28676 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCAP28676 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms