Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms