Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms