Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFTRP13569 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFTRP13569 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFTRP13569 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms