Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PCNAP12004 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PCNAP12004 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNAP12004 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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