Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
E2F8A0AVK6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms