Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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