Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms