Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms