Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms