Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX2Q9BZI1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRX2Q9BZI1 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IRX2Q9BZI1 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms