Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LPIN3Q9BQK8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms