Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms