Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms