Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CAVIN4Q5BKX8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CAVIN4Q5BKX8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CAVIN4Q5BKX8 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CAVIN4Q5BKX8 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAVIN4Q5BKX8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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