Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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