Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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