Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms