Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
E2F1Q01094 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms