Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR2FP61218 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2FP61218 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms