Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CLDN15P56746 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CLDN15P56746 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms