Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms