Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms