Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFC5P40937 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms