Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLD1P28340 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms