Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
IL3RAP26951 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IL3RAP26951 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms