Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB3O43889 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CREB3O43889 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CREB3O43889 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CREB3O43889 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CREB3O43889 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CREB3O43889 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CREB3O43889 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CREB3O43889 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB3O43889 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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