Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms