Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms