Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FRMD3A2A2Y4 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms