Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAF6Q9Y4K3 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAF6Q9Y4K3 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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