Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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