Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf16Q9BUW7 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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