Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GCSAMQ8N6F7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms