Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TDRD12Q587J7 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms