Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTCH1Q13635 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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