Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms