Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms